猪流行性腹泻病毒检测与S蛋白中和抗原表位基因分析

丁卫星1,王荣谈 ,郭佳宏2,廖学文2,缪德年2*

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上海农业学报 ›› 2016 , Vol. 32 ›› Issue (1) : 19-22.
论文

猪流行性腹泻病毒检测与S蛋白中和抗原表位基因分析

  • 丁卫星1,王荣谈 ,郭佳宏2,廖学文2,缪德年2*
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Detection of porcine epidemic diarrhea virus and analysis of neutralizing antigen epitope gene of S protein

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摘要

应用RT-PCR对2015年江苏、安徽、山东9个猪场的腹泻样品(新鲜粪便、肠道组织等)进行PEDV和TGV检测,并对检测到的一株PEDV(CHNJPK2015)的纤突蛋白中和抗原表位基因进行克隆测序和遗传进化分析。结果表明:9个猪场PEDV检测阳性率为100%,PEDV个体阳性率为63.89%,TGEV均未检出,说明本次流行的仔猪腹泻病主要是由PEDV感染引起的。所测毒株与参考毒株可分为3个群,CHNJPK2015株与AVCT12、Br1/87、CHM2013、LZC、SM98等毒株的S蛋白中和抗原表位基因的遗传距离较近,核苷酸序列同源性达99.5%?99.8%,处于同一群;而与2014年中国各地分离的CH/GDZQ/2014、FJ-FQ 2014、FJ-ZP 2014、PEDV-LY、PEDV-WS、PZ1406、SC1402、SH1404和疫苗株CV777序列的遗传距离较远,核苷酸序列同源性为92.9%?96.2%,处于不同的群。

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丁卫星1,王荣谈 ,郭佳宏2,廖学文2,缪德年2*. 猪流行性腹泻病毒检测与S蛋白中和抗原表位基因分析[J]. 上海农业学报. 2016 , 32 (1): 19-22.
. Detection of porcine epidemic diarrhea virus and analysis of neutralizing antigen epitope gene of S protein[J]. Acta Agriculturae Shanghai. 2016 , 32 (1): 19-22.

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