基于SNP芯片分析嘉定梅山猪遗传多样性和群体结构及应用

涂尾龙, 王洪洋, 张莺莺, 黄济, 高骏, 甘叶青, 卞益, 谈永松

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上海农业学报 ›› 2025 , Vol. 41 ›› Issue (2) : 89-95. DOI: 10.15955∕j.issn1000-3924.2025.02.13
畜牧·兽医

基于SNP芯片分析嘉定梅山猪遗传多样性和群体结构及应用

  • 涂尾龙1,王洪洋1,张莺莺1,黄济1,高骏1,甘叶青,卞益,谈永松1*
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Analysis of genetic diversity and population structure of Jiading Meishan pigs based on SNP chips and its applications

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摘要

通过单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片对嘉定梅山猪333头进行SNP分型,分析嘉定梅山猪遗传多样性及群体结构,计算嘉定梅山猪群体近交系数,通过进化树重新划分家系,并以新的家系为基础规划保种方案,指导保种生产。结果表明:嘉定梅山猪群体观察杂合度为0.173,期望杂合度0.175,平均基因组近交系数为0.148,存在一定程度的近交;根据SNP芯片对梅山猪群体亲缘关系分析,并剔除掉生产性能较低种猪,将种猪群体划分为7个家系。据新家系制定配种计划生产,2024年嘉定梅山猪产仔数较上一年平均提高2.11头,产活仔数平均提高0.97头。该研究可为提高嘉定梅山猪生产性能提供参考。

关键词

嘉定梅山猪 / 单核苷酸多态性 / SNP芯片 / 遗传多样性 / 群体结构

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涂尾龙, 王洪洋, 张莺莺, 黄济, 高骏, 甘叶青, 卞益, 谈永松. 基于SNP芯片分析嘉定梅山猪遗传多样性和群体结构及应用[J]. 上海农业学报. 2025 , 41 (2): 89-95. https://doi.org/10.15955∕j.issn1000-3924.2025.02.13
. Analysis of genetic diversity and population structure of Jiading Meishan pigs based on SNP chips and its applications[J]. Acta Agriculturae Shanghai. 2025 , 41 (2): 89-95. https://doi.org/10.15955∕j.issn1000-3924.2025.02.13

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